کلرید آمونیوم در صنایع داروسازی برای تولید انواع شربت های اکسپکتورانت که برای سیستم تنفسی و گلودرد تجویز می شوند، مورد استفاده قرار می گیرد. این ماده در صنایع غذایی به عنوان ماده مغذی مخمرها در تولید نان مصرف می شود.

مهم ترین موارد کاربردی ترکیب کلرید آمونیوم، استفاده از آن برای تولید کودهای نیتروژن دار است. تقریباً حدود 90% تولید جهانی این ماده برای این کاربرد مصرف می شود. ترکیباتی نظیر کلرو آمونیوم فسفات، یکی از انواع کودهای تولید شده توسط کلرید آمونیوم است. این کود برای محصولات کشاورزی برنج و گندم در زمین های کشاورزی مصرف می شود.

در صنایع دارویی و غذایی به عنوان ماده کمکی کاربرد فراونی دارد که از نوع خاصی از سلولز چوب آلفا تشکیل شده است و به عنوان بافت دهنده کاربرد دارد.

در صنایع غذایی به عنوان امولوسیون فایر و جایگزین چربی ها و حجیم کننده کاربرد دارد.

بیشترین کاربرد دارویی این ماده به عنوان مکمل های ویتامین یا قرص ها می باشد.